Seguem as alterações necessárias para transformar um telefone em um link clicktocall :

1 - Verificando se usuario logado está com recurso clicktocall liberado (PHP):
Obs.: $voip_enabled é o boolean que contém essa informação.

//Begin: Enable/Disable VoIP Service -> Voip Server Config
    $voip_enabled = false;
    $voip_groups = array();   
    if($GLOBALS['phpgw_info']['server']['voip_groups']) {
        $emailVoip = false;
        foreach(explode(",",$GLOBALS['phpgw_info']['server']['voip_groups']) as $i => $voip_group){
            $a_voip = explode(";",$voip_group);           
            $voip_groups[] = $a_voip[1];
        }
        foreach($GLOBALS['phpgw']->accounts->membership() as $idx => $group){           
            if(array_search($group['account_name'],$voip_groups) !== FALSE){         
                $voip_enabled = true;
                break;
            }
        }
    }
//End: Enable/Disable VoIP Service -> Voip Server Config


2- Montando link clicktocall (Javascript):
Obs.: phoneUser é a variável que contém o telefone de destino. Vira uma tag HREF com link clicktocall, se habilitado.

// Verifica se o usuário tem o recurso VoIP ativado e se tem telefone cadastrado no Expresso
if(preferences.voip_enabled && phoneUser) {
            phoneUser = "<a title='Discar para esse telefone' href='#' onclick='javascript:connectVoip(\'"+phoneUser+"\', \'com\')'>"+phoneUser+"</a>";
}

3 - Implementando função connectVoiP (Javascript)

var connectVoip = function (phoneUser, typePhone){
    var handler_connectVoip = function(data){
        if(!data) {
            alert(get_lang("Error contacting VoIP server."));
        }
        else{
            alert(get_lang("Requesting a VoIP call")+":\n"+data);
        }
    }
  // HTTPRequest
    cExecute ("$this.functions.callVoipConnect&to="+phoneUser+"&typePhone="+typePhone, handler_connectVoip);
}

4 - Implementando classe PHP com método callVoipConnect:

class Functions{
              
        function CallVoipConnect($params){       
            $fromNumber = $_SESSION['phpgw_info']['user']['preferences']['expressoMail']['telephone_number'];
            if(!$fromNumber)
                return false;
            $fromNumber = substr($fromNumber,strlen($fromNumber) - 4, strlen($fromNumber) - 1);
            $toNumber    = $params['to'] ? substr($params['to'],strlen($params['to']) - 4, strlen($params['to']) - 1) : 0;
           
            $voipServer    = $_SESSION['phpgw_info']['expressomail']['server']['voip_server'];
            $voipUrl    = $_SESSION['phpgw_info']['expressomail']['server']['voip_url'];
            $voipPort    = $_SESSION['phpgw_info']['expressomail']['server']['voip_port'];
                           
            if(!$voipServer || !$voipUrl || !$voipPort)
                return false;
            $url        = "http://".$voipServer.":".$voipPort.$voipUrl."?magic=1333&acao=liga&ramal=".$fromNumber."&numero=".$toNumber;           
            $sMethod = 'GET ';
            $crlf = "\r\n";
            $sRequest = " HTTP/1.1" . $crlf;
            $sRequest .= "Host: localhost" . $crlf;
            $sRequest .= "Accept: */* " . $crlf;
            $sRequest .= "Connection: Close" . $crlf . $crlf;           
            $sRequest = $sMethod . $url . $sRequest;   
            $sockHttp = socket_create(AF_INET, SOCK_STREAM, SOL_TCP);           
            if (!$sockHttp)  {
                return false;
            }
            $resSocketConnect = socket_connect($sockHttp, $voipServer, $voipPort);
            if (!$resSocketConnect) {
                return false;
            }
            $resSocketWrite = socket_write($sockHttp, $sRequest, strlen($sRequest));
            if (!$resSocketWrite) {
                return false;
            }   
            $sResponse = '';   
            while ($sRead = socket_read($sockHttp, 512)) {
                $sResponse .= $sRead;
            }           
           
            socket_close($sockHttp);           
            $pos = strpos($sResponse, $crlf . $crlf);
            return substr($sResponse, $pos + 2 * strlen($crlf));                                   
        }
}
 
IMPORTANTE

Para que o método CallVoipConnect (AJAX) funcione corretamente, é
necessário popular alguns valores do $GLOBALS para $_SESSION na index.php
ou em outro PHP usado para montar a página que terá o "Clicktocall" . São eles:

$_SESSION['phpgw_info']['user']['preferences']['expressoMail']['telephone_number'] = $GLOBALS['phpgw_info']['user']['telephonenumber'];
$_SESSION['phpgw_info']['expressomail']['server'] = $GLOBALS['phpgw_info']['server'];


As variáveis da $_SESSION usadas são do ExpressoMail, pois já tem lá atualmente.